Ochrona jezior, ale też wyeliminowanie zjawiska smogu, to poważne wyzwania stojące przed Funduszem Ochrony Środowiska i Gospodarki Wodnej w Olsztynie. Najważniejszym środkiem do osiągnięcia tego celu są działania edukacyjne, które powinny być prowadzone wśród mieszkańców już od najmłodszych lat. Dlatego fundusz wspiera proces edukacyjny na każdym etapie, zaczynając go już w przedszkolach.
Fundusz zajmuje się również przekazywaniem środków na rzecz ochrony środowiska, na różnego rodzaju inwestycje związane z działaniami ekologicznymi we współpracy z Narodowym Funduszem Ochrony Środowiska, który przekazuje pieniądze na te zadania.
Mimo, że region nie jest tak bardzo jak inne zagrożony zjawiskiem smogu, jednak priorytetem jest przyjęcie pakietu antysmogowego, który pozwoli zapobiegać powstawaniu tego problemu.
